Генетическая оценка пары

Сначала вам направляться иметь ясное представление об неспециализированном замысле разведения на основании факторов, обсуждаемых в 8.5 и 8.6. направляться решить, стремитесь ли вы поддерживать по возможности громадную вариабельность генов либо собираетесь усилить определенные геномы получением генетических линий. Следовательно, вам нужна некая информация довольно имеющихся у птицы генов.

Генетическая оценка пары В большинстве случаев для этого употребляются родословные (рисунок 2.2.1). Они разрешают заметить пара предшествуюших поколений, допустимо кроме того до основателей рода. Они кроме этого дают дополнительную нужную данные, к примеру, как выращивалась эта птица и кто ее вывел. Родословная возможно связана с компьютерной племенной книгой, таковой как SPARKS. Применять родословные несложно, они лежат в базе замысла по разведению. Страно, что очень немногие люди, беря ловчую птицу, проявляют какой-либо интерес к ее родословной. Со временем это изменится, клиенты станут более разборчивы.

Еще меньше людей могут пользоваться родословной. Слишком мало взглянуть на родословную новой птицы и сообщить: «О, нужно же это внучка Мчащегося Гурмана — она должна быть хорошей!» Что, если вы захотите создать несколько из двух птиц и заметите, что они имеют неспециализированных предков? Как вы вычислите степень родства?

К сожалению, генетика на 90% есть теорией и только на 10% практикой. Давайте сперва посмотрим, что свидетельствует родство. Начнем с двух кречетов, один с Аляски, второй из Гренландии. Похоже, они не должны пребывать в родстве. Неверно. Само собой разумеется они генетически связаны, в противном случае они не были бы кречетами. Вопрос: какова степень родства? К примеру, люди и шимпанзе имеют 95% неспециализированных генов. Они практически однообразны. Все мы в какой-то степени родственники и нам направляться оценить, что свидетельствует фоновый уровень родства.

При скрещивании двух животных, каждое из них поставляет половину генного комплекта. Значит, возможно заявить, что степень родства между ребёнком и родителем образовывает половину (0.5. либо 50%). То же самое возможно сообщить про сибсов: сёстры и братья имеют степень родства 50% (не считая однояйцевых близнецов, у которых степень родства образовывает 100%). Фоновый уровень родства лежит между этим родным родством в 50% и нулем. В генетически разнообразной популяции фоновый уровень родства должен быть низким, до 15%, но в замкнутых популяциях он может быть около 40%. Значит, мы можем заявить, что отечественные птицы не пребывают в родстве и что их коэффициент родства равен нулю.

Для простоты SPARKS и похожие племенныe книги предполагают, что основатели родов не пребывают в родстве. Единственным методом узнать, соответствует ли фоновый уровень родства, это проанализировать профиль ДНК и вычислить его. Мы делали это в рамках изучения новозеландского сокола. Нам было нужно отловить всех диких соколов во всей области вероятного скрещивания, забрать у них кровь и изучить ДНК. Это послужило нам отправной точкой. Мы поняли, что кое-какие особи, отловленные за 300 километров друг от друга, были связаны 50%-м родством. Это указывает, что они были близки как брат с сестрой! И это для основателей рода, якобы не имеющих родственных связей! Это не свидетельствует, что они вправду были сестрой и братом, это значит, что особи в всей популяции были близко связаны между собой, в силу того, что в какой-то момент популяция очень сильно сократилась, а после этого опять разрослась. Это не обязательно не хорошо. Сильная замкнутость популяции оказывает помощь искоренить нехорошие reны, и тогда предстоящий инбридинг менее вреден. Инбридинг в более разнообразной популяции скорее выльется в «генетические скелеты в шкафу».

Такие виды, как королевский канюк, в природе смогут иметь очень разнообразные популяции, но, в другую страну для разведения смогут привезти только десять особей. Из этих десяти, быть может, только шесть удастся развести. Из них только одна пара выведет половину птенцов. В начале это не весьма драматично, но лет через десять линия закончится, как это произошло с некоторыми отечественными видами, и тorдa появятся неприятности.

Вычисления коэффициента родства и построение графиков ковариантности сверхсложное занятие. Но, проследить степень родства в несложной родословной из трех-четырех поколений несложно. Вот что вам направляться делать:

Заберите родословные двух птиц, которых вы планируете скрещивать, и положите их рядом. В случае, если у них нет неспециализированных предков, то для практических целей возможно допуcтить, что они не родственны друг другу, либо вернее, что степень их родства близка к фоновому уровню. Давайте выберем пары с тремя неспециализированными предками, Jessica, Gem, и Shade, каковые являются дикими птицами:

Генетическая оценка пары

Степень родства между двумя последуюшими поколениями образовывает 50 процентов. Сперва проследим происхождение Jessica до Olivia. Они (Jessica и Olivia) имеют степень родства 0.5 Х 0.5=0.25. Степень родства Pang с Jessica образовывает 0.5. Значит, по этому неспециализированному предку (по Jessica) Olivia и Pang имеют степень родства 0.25 Х 0.25=0.125.

По Gem их степень родства образовывает 0.5 Х 0.5 Х 0.5 Х 0.5=0.0625.

Вычислить степень родства по Shade сложнее. Shade есть дедушкой Olivia с обоих сторон, это удваивает генетический вклад для данного поколения. Значит, степень родства Olivia и Pang образовывает 0.5 Х 0.5 + 0.5 Х 0.5 = 0.5. Вклад Pang образовывает 0.5 Х 0.5 = 0.25, значит в итоге 0.5 Х 0.25 = 0.125 для Shade.

Потом мы складываем все коэффициенты родства по всем неспециализированным предкам:

Jessica = 0.125

Gem=0.0625

Shade = 0.125

Итого = 0.3125.

Что это указывает? Пары, имеющие коэффициент выше, чем 0.25, склонны проявлять черты инбридинга. Это возможно генетический недостаток, к примеру, перекошенный клюв, либо это возможно подавление функций, к примеру, сниженная свойство к выведению птенцов, что кроме этого зависит от пропорции «нехороших» генов в популяции. Но как неспециализированное правило, старайтесь не скрещивать птиц, имеющих степень родства громадную, чем 0.125. Olivia и Pang обречены на безответную любовь, и нам нужно будет искать им альтернативу. Вот таким вот образом родословные употребляются селекционерами. В случае, если селекционер желает усилить конкретный показатель, к примеру, свойство набирать высоту, он обязан проводить линию скрещивания от предков, у которых эта свойство отлично развита.

Оценка генетического статуса эмбрионов по результатам МПС (NGS)


Интересные записи:

Понравилась статья? Поделиться с друзьями: